Taman Nasional Teluk Cenderawasih terletak di ujung timur Indonesia yaitu tepatnya di Propinsi Papua dan Papua Barat. Keunikan kawasan ini adalah adanya keanekaragaman sumber daya hayati laut dan daratan pulau yang cukup tinggi. Dari hasil survey The Nature Conservation (TNC), World Wide Fund for Nature (WWF), Conservation International Indonesia (CI- Indonesia) dan TNTC bulan Februari 2006, tercatat ± 460 jenis karang, yang terdiri dari 67 genus dan sub genus 260 jenis karang Scleractinia tersebar pada tepi pulau baik pulau besar maupun kecil.
Di kawasan TNTC ditemui sebanyak 836 jenis ikan yang terdiri dari : jenis ikan muara, ikan mangrove, ikan karang dan ikan pelagis (Hasil survey Balai Besar TNTC, Universitas Negeri Papua dan CI-Indonesia tahun 2008), dan 201 spesies moluska.
Untuk keragaman flora-fauna daratan terdapat 17 jenis vegetasi mangrove, 9 jenis vegetasi hutan pantai, 35 jenis vegetasi hutan daratan, 7 jenis lamun, 184 jenis burung, 14 jenis mamalia dan 17 jenis reptilia.
